回望上山遗址发现后的这二十年，上山文化的内涵日益丰富，并且在世界考古界中大放异彩，这离不开国内外众多考古专家和学者们的共同努力。2007年，11月，为推进上山文化的研究，浦江县政府挂牌成立了“上山文化研究中心”，积极配合、支持围绕上山文化研究的工作。 

二十年里，来自澳大利亚、美国、香港、中科院、北大等国内外著名的专家、学者，组成多学科的科研力量对上山遗址、上山文化进行深入研究，共计100余次。 

    浙江省文物考古研究所植物考古专家郑云飞率先进行夹炭陶片中的植物硅酸体及稻谷形态研究。中国社会科学研究院考古研究所赵志军研究员在上山遗址2004年、2005年、2006年、2008年度的发掘工作中，开展了浮选工作，获取遗址中埋藏的植物遗存，并对浮选出土的植物遗存进行整理、分类、鉴定和量化分析。 2008年6月，香港中文大学人类学系吕烈丹教授对上山遗址出土的打制石器进行了系统性的研究工作。10月，澳大利亚拉筹伯大学考古专家刘莉考察上山遗址，对遗址出土的石器、陶器表面进行微痕及淀粉残余物提取，并通过采集的谷类、豆类、茎块类植物以及橡子、板栗、菱角、莲子等进行研究对比分析，以求得上山人的食物结构信息。12月，美国亚利桑那大学人类学系谢礼晔博士对上山遗址的打制石器做了分类整理。2011年8月，英国莱切斯特大学植物考古专家Huw Barton、中科院地理研究所杨小燕博士考察上山遗址，并提取了上山遗址出土陶石器表面残余物作具体分析研究。2015年4月，浙江大学地球科学学院教授林舟赴浦江上山遗址考察研究，通过实地查勘上山遗址的地理方位及周边地形地貌，深入研究和探索上山遗址地质地貌。6月，加拿大多伦多大学教授、皇家科学院院士Gary W. Crawford对上山遗址的陶器和水稻遗存进行研究。11月，同为加拿大多伦多大学上山遗址研究国家科题组专家组成员、教授Joseph Desloges 对上山遗址的地形地貌进行研究。中国科学院专家前来上山遗址考察，并提取地层标本，以在统一标准下系统地重新鉴别“上山文化”时期各遗址的地层年代。安徽大学动物考古专家戴玲玲博士，前来浦江就上山遗址出土的动物遗存进行考古研究。同时还整理上山遗址发掘的动物骨头，送相关机构进行检测。